Ahhoz, hogy ebben a tágas belső térben mindig biztosítani lehessen a tökéletesen kellemes légkört, különösen nagyteljesítményű klímaberendezést kellett kifejleszteni. Az R-osztály alapfelszereltségének része a THERMATIC automatikus klímaberendezés, amely kombinált szűrővel és két zónával – külön-külön a vezető és az első utas oldalán – gondoskodik a kellemes hőmérsékletről.

Kívánságra a többzónás THERMOTRONIC automatikus klímaberendezés is elérhető. Ez a rendszer három külön beállítási zónát nyújt a vezető, az első utas és a hátsó utasok számára. A szabályozás a második üléssorból is történhet.

A középkonzol hátsó részében 12 V-os csatlakozóalj és két, rendelhető, kihúzható pohártartó található. Ugyanitt kaptak helyet a hátsó klímaberendezés (csak az automatikus klímaberendezéssel együtt érhető el) kezelőszervei is. Ennek külön fúvókái a hátsó oldalfalborításokon találhatók.
A vezető és az első utas opcionális ülésklímája kellemes légáramlattal és kapcsolható ülésfűtéssel csökkenti az izzadást és fokozza a hosszú utazások komfortját. A kárpitba épített ventilátorok egyenletesen osztják el a levegőt az ülőlap és a támla bőrbevonata alatt; a levegő finom perforáláson lép ki, és hamar lehűti kellemes hőfokúra az ülőfelületet – akkor is, ha előzőleg felforrósodott az autó a napsütésben. Hidegben a háromfokozatú ülésfűtés, együttműködve az ülésszellőzéssel, szárítja meg gyorsan a nedves ruházatot.